Στο Συμβούλιο της Επικρατείας κατέφυγες ο Πανελλήνιος Φαρμακευτικός Σύλλογος και ο Φαρμακευτικός Σύλλογος Αττικής, όπου κατέθεσε αιτήσεις ακυρώσεως, καθώς επίσης και αιτήσεις αναστολής εκτελέσεως κατά της Κοινής Υπουργικής Απόφασης που αλλάζει πλήρως και απορρυθμίζει το μέχρι σήμερα ισχύον ιδιοκτησιακό καθεστώς των φαρμακείων προς όφελος των μονοπωλίων.

Στο σκεπτικό των αιτήσεων που κατατέθηκαν εκ μέρους του ΠΦΣ από το Νομικό Σύμβουλο κ. Ηλία Δημητρέλλο και τον Δικηγόρο κ. Αποστ. Παπακωνσταντίνου, και από την Νομική Σύμβουλο του ΦΣΑ κ. Σοφία Αγγέλου, αναφέρεται ότι η προσβαλλόμενη ΚΥΑ είναι ευθέως αντισυνταγματική και αντίθετη με το Ενωσιακό κεκτημένο (Ενωσιακό Δίκαιο, νομολογία του Δικαστηρίου της Ευρωπαϊκής Ένωσης- ΔΕΕ).

Το ΣτΕ με σειρά αποφάσεών του (228/2014 η πλέον πρόσφατη) έχει δεχθεί ότι τα φαρμακεία δεν αποτελούν αμιγώς εμπορικές επιχειρήσεις, αλλά  ιδιότυπα καταστήματα, στα οποία συνδυάζεται η υπεύθυνη επιστημονική δραστηριότητα και η κοινωνική αποστολή με την εμπορική εκμετάλλευση, το δε  ΔΕΕ (αποφάσεις C 171/07, C 172/07 και C 531/06), εκτός των άλλων, έχει δεχθεί ότι ο περιορισμός της ιδιοκτησίας των φαρμακείων αποκλειστικά από φαρμακοποιούς διασφαλίζει την ανεξαρτησία των φαρμακευτικών υπηρεσιών και αποτρέπει συγκρούσεις συμφερόντων.